برنامه پیام رسان لاین در حال حاضر به شما اجازه می دهد که پیام های خود را رمز گذاری کنید . این ویژگی در برنامه پیام رسان iMessage اپل و واتس آپ در دسترس بود و حالا در لاین در دسترس خواهد بود.
با استفاده از Line calls و ویژگی Letter Sealing امکان رمز گذاری در گوشی هوشمند شما ذخیره خواهد شد و در نهایت شما امکان قفل کردن پیام های خود برای در دسترس نبودن همگان را خواهید داشت . از دیگر ویژگی های منحصر به فرد آن می توان به اشتراک گذاشتن چت ها و مکان ( Location ) اشاره کرد.
از دیگر ویژگی های لاین می توان به چت گروهی و جدول زمانی پیام ها اشاره ای نمود که از قبل در دسترس بودند ولی رمز گذاری پیام ها از ویژگی های پیشنهادی و مورد درخواست کاربران بود. با ویژگی Timeline کاربران می تواند پیام های نوشتاری و تصاویر را برای دوستان خود ارسال کند و برای کاربر مانند یک دفترچه خاطرات است.
برای اولین بار کاربران اندروید و iOS در برنامه لاین می توانند پیام های خود را رمز گذاری کنند
برنامه لاین همچنین در دیگر سیستم عامل ها از جمله : بلک بری ، ویندوز فون ، فایر فاکس و مک اجرا می شود.
استفاده از ویژگی رمز گذاری بستگی به قانون منطقه شما دارد . در حال حاضر بیش از 600 میلیون کاربر لاین در کشور های ژاپن و کشورهای جنوب شرقی آسیا مانند تایلند و اندونزی به این ویژگی دسترسی دارند.
در آبان 2014 کشور تایلند نظارت بر پیام های ارسالی مردم این کشور را تایید کرد . لاین این موضوع را تکذیب کرد اما به این معنا نبود که دولت تایلند به حریم خصوصی مردم کشور خود تجاوز نکرده باشد . بنابراین یکی از نگرانی های مردم نظارت بر پیام هایشان در برنامه لاین است . روزانه 40 میلیون پیام در لاین ارسال می شود.